| Terme : Description en langage naturel représentant un concept
Concept : Unité de connaissance créée par une combinaison unique de caractéristiques
Concept codé : Concept associé à un code unique représentant ce concept dans les SI
Code / identifiant : Chaîne de caractères unique, reconnaissable par les SI
Plan de codage (coding scheme) : Collection de règles qui relient les éléments d’un ensemble (« l’ensemble codé ») aux éléments d’un second ensemble (« l’ensemble de codes »)
Système de codage (coding system) : Combinaison d’un ensemble de concepts, d’un ensemble de codes, et d’au moins un plan de codage associant les codes aux concepts
Thésaurus : Liste organisée de termes contrôlés et normalisés représentant les concepts d’un domaine de la connaissance
Classification : Ensemble exhaustif de catégories mutuellement exclusives (classes) pour agréger des données à un niveau de spécialisation prescrit dans un but spécifique
Ontologie : Spécification formelle et explicite des concepts d’un domaine et de leurs relations
Nomenclature : Instance de classification servant de référence dans un champ donné
Terminologie de référence : Ensemble de désignations de niveau atomique structurées pour sous-tendre les représentations de concepts simples et de concepts compositionnels indépendants du langage humain (à l’intérieur d’un système informatique). Donc c’est le choix d’une association Système de codage + (Thésaurus ou Classification ou Ontologie ou Nomenclature)
Jeu de valeurs : Un ensemble identifié de valeurs valides, consistant en des concepts codés tirés d’une ou plusieurs terminologies de référence. Un jeu de valeurs est typiquement associé à un domaine de concepts pour spécifier les valeurs permises à l’intérieur d’une spécification d’échange de données.
Alignement sémantique : Table de correspondance croisée entre les concepts de deux terminologies de référence.
Singularité : Champ sémantique couvert par une unique terminologie. | | |
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UCUM : Unified Code for Units of Measure, normalisation des unités de mesure |
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HeTOP portail multiterminologique du CiSMeF (CHU de Rouen) |
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Base du CIP : UCD (Lien non faisable !) et intitulés (sur inscription) |
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BioPortal : collection d’ontologies biologiques et médicales hébergée par l’université de Stanford |
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ISO EN13606 community
This site provides information and implementation resources for ISO 13606 standard for Electronic Health Record Communication.
We are an open community for everybody interested in implementing and using ISO 13606. |
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ISO 11616 : Informatique de santé — Identification des médicaments — Éléments de données et structures pour l’identification unique et l’échange d’informations réglementées sur les produits pharmaceutiques |
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SAGE Project : collaborative project to develop a universal framework for encoding and disseminating electronic clinical guidelines |
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Open Clinical : technical, clinical and political contexts to the field of clinical knowledge management technologies and applications |
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| « Consultation du jeu de valeurs LOINC biologie
Consultation des alignements de LOINC biologie avec la NABM
Demande de créations et de corrections » | |
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EphMRA : « The Anatomical Classification of Pharmaceutical Products has been developed and maintained by the European Pharmaceutical Market Research Association (EphMRA) and is therefore the intellectual property of this Association » |
| ATC (Lien non faisable !) liée aux AMM européennes | |
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| ATC (Lien non faisable !) de l’OMS | |
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| « En linguistique, une langue contrôlée est généralement définie comme un sous-ensemble d’une langue naturelle, dont la grammaire et le vocabulaire ont été restreints afin de réduire l’ambigüité et la complexité des textes.» | |
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ISO/TS 19256:2016 Informatique de santé - Exigences pour les systèmes de dictionnaires de produits médicaux pour les soins de santé (boutique de l’ISO) |
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DreamQuarck : « Our Challenge
How can we better analyze the large amounts of data collected until today, and help the insurance, financial services and healthcare sectors invent better data intelligence ?» |
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| Lien mort | |
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| La CISP est administrée par la Wonca | |
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CIM-11
Classification Internationale des Maladies Onzième Révision
La norme internationale pour l’évaluation de l’état de santé |
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| Incorporée à l’UMLS | |
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| Consignes de codage des séjours liés au COVID-19
ATIH
Mise à jour le 1/10/2020
Codage d’un séjour MCO pour suspicion, diagnostic et traitement de COVID-19 | |
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| Utilise MeSH et ATC (Lien non faisable !) | |
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EDS-NLP is a contributive effort maintained by AP-HP’s Data Science team. Have a look at the documentation for more information on the available pipelines. |
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FDA’s Global Substance Registration System (GSRS) enables efficient and accurate exchange of information on substances through their Unique Ingredient Identifiers (UNIIs) which can be generated at any time in the regulatory life cycle. |
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NCBI
The National Center for Biotechnology Information advances science and health by providing access to biomedical and genomic information. |
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Bienvenue sur Sesali, le Service européen de santé en ligne
Sesali est le Service européen de santé en ligne. Actuellement, il permet aux professionnels de santé français d’accéder de manière sécurisée à la synthèse médicale d’un patient provenant d’un autre pays de l’Union européenne.
Plus de barrière linguistique : allergies, traitements en cours, maladies et interventions chirurgicales antérieures sont des exemples de données de santé que Sesali pourra afficher en français.
Sesali est proposé par l’ANS, sous l’égide du Ministère chargé de la santé, en collaboration avec la Commission européenne et plus d’une vingtaine de pays européens afin d’assurer la continuité des soins des citoyens à l’échelle européenne. |
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| Document en français |
| La gouvernance de l’interopérabilité sémantique est au coeur du développement des systèmes d’information en santé
Rapport à la ministre de la santé et des sports
Professeur Marius Fieschi
9 juin 2009 | |
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| Document en français |
| Livre blanc
Données massives - Big Data
Impact et attentes pour la normalisation
AFNOR, juin 2015 | |
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| Document en français |
| Exigences d’interopérabilité adoptées en GT certification HAS des LAD de PUI le 15/6/2017 | |
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| Document en français |
| Evaluation de conformité et interopérabilité en informatique de santé
Point de vue du SQIM de la HAS
Présentation le 8/3/2012 dans une réunion au Cofrac centrée sur l’accréditation des laboratoires de biologie | |
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| Document en français |
| Présentation de la certification HAS des LAP hospitaliers à la Société Française d’Anesthésie-Réanimation (SFAR) le 22/9/2010 | |
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| Document en français |
| INSTRUCTION N° DGOS/SR6/R3/R4/DREES/DMSI/2014/364 du 24 décembre 2014 relative à la modification de la nomenclature des activités portant sur les activités soumises à autorisation, autres que les activités de soins, et les activités soumises à reconnaissance contractuelle | |
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| Document en anglais |
| Dictionary of Medicines and Devices - Glossary 1.0
http://webarchive.nationalarchives.gov.uk
2/7/2013 | |
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| Document en français |
| Recueil des besoins et usages en terminologies de référence et outils associés
ASIP Santé / DSSIS
Compte rendu d’interview de la HAS le 4/2/2015
A la demande de la HAS, ce document a été déclassifié | |
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| Document en français |
| Support de la réflexion de la HAS le 26/10/2015 sur l’administration des terminologies | |
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| Document en français |
| Référentiel d’interopérabilité sémantique : mise en oeuvre de terminologies de référence pour le secteur santé-social en France
ASIP septembre 2014 | |
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| Document en français |
| Support de la réunion du 1/2/2016, restitution de la phase 3 de l’étude sur la gouvernance des terminologies | |
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| Document en français |
| Rapport de la phase 2 – « Diagnostic » dans la cadre de l’étude sur la mise en œuvre de terminologies de référence pour le secteur santé-social | |
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| Document en français |
| HL7 ‘Working Group Meeting’ de mai 2016
Les points saillants (compte-rendu) | |
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| Document en français |
| Instruction no SG/DSSIS/INCa/2016/109 du 5 avril 2016 relative à l’actualisation pour 2017 de la cible du système d’information du dossier communicant de cancérologie (DCC) | |
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| Document en anglais |
| Assessing SNOMED CT for Large Scale
eHealth Deployments in the EU | |
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| Document en français |
| Approche sémiotique des pratiques professionnelles en médecine physique et de réadaptation
Thèse pour le Doctorat de l’Université de Limoges
Discipline : Sciences du Langage
Présentée et soutenue publiquement par Jean-Michel Wirotius le vendredi 7 avril 2006 | |
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| Document en anglais |
| Deliverable 2.3 openMedicine final identifying and descriptive attributes, OpenMedicine (HL7 - IHE ?) 4/8/2016 | |
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| Document en français |
| Méthodologie pour la mise en relation des terminologies médicales, thèse de Tayeb Merabti, Juin 2010 | |
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| Document en français |
| Livre blanc « Dématérialisation de la prescription d’examens de biologie médicale »
IHE et ASIP, novembre 2016 | |
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| Document en français |
| Fonctionnalités LAP-LAD en relation avec la facturation des médicaments hors GHS, support de la participation de la HAS au groupe de réflexion DSS-ATIH du 9/12/2016 | |
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| Document en français |
| Support de la présentation de Pierre LIOT sur les systèmes d’aide à la décision lors de la journée des partenaires Vidal le 14/6/2017 à Levallois-Perret | |
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| Document en français |
| Convention permettant à HL7 d’incorporer certains termes SNOMED CT. A pour conséquence, pour un pays non adhérent à SNOMED CT de rendre payante l’utilisation d’une telle norme HL7 | |
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| Document en français |
| Présentation de Bioportal du CHU de Montpellier à l’occasion de la réunion du 16/6/2017 sur la gouvernance des terminologies | |
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| Document en français |
| Pourquoi et comment enregistrer la situation sociale d’un patient adulte en médecine générale ?
CMG ? 8 janvier 2014
Les annexes sont une bonne base de travail pour la structuration de cette partie du dossier médical | |
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| Document en français |
| Réponse de la HAS concernant le rapport de phase 4 de l’étude terminologies, particulièrement sur la question SNOMED CT
HAS le 26/12/2017 | |
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| Document en français |
| Instruction DGCS/2018/18 du 22 janvier 2018 relative à l’application de la nomenclature des établissements et services sociaux et médico-sociaux accompagnant des personnes handicapées ou malades chroniques | |
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| Document en français |
| Données de santé, 7 propositions pour changer de perspective
Think tank Lir Imaginons la santé, juin 2018 | |
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| Document en français |
| Contrat de licence d’utilisation de SNOMED 3.5 VF
ASIP santé | |
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| Document en anglais |
| Framework for FDA’s real world evidence program
FDA, December 2018 | |
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| Document en français |
| Alignements des médicaments (CIP (Lien non faisable !) 13 caractères) éligibles ou non selon l’ALD (Lien non faisable !)
Assurance maladie, juillet 2019 | |
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| Document en français |
| Nomenclatures besoins et prestations détaillées
Serafin-PH
CNSA avril 2018
Mise à jour décembre 2020 | |
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| Document en français |
| Recommandations S.F.P.O. Plantes et compléments alimentaires dans la prise en charge du patient atteint de cancer
Société Française de Pharmacie Oncologique, édition n°1, janvier 2020 | |
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| Document en anglais |
| Procedural document: Orphanet nomenclature and classification of rare diseases
Orphanet, Version 2, March 2020 | |
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| Document en français |
| Mobilisation globale dans le cadre de la stratégie d’accélération de la santé numérique
Rapport à Madame la Ministre déléguée, auprès du Ministre de l’économie, des finances et de la relance, chargée de l’industrie
établi par Robert Picard
Avril 2021 | |
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| Document en français |
| ADICAP - Index raisonné des lésions Présentation détaillée
Version 1.0
ASIP santé date ? | |
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| Document en français |
| Référentiel des critères pour intégrer le catalogue de Mon espace santé
Juillet 2022
Référencement | |
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| Document en français |
| Etude sur les besoins de codage et la structuration des données de santé en soins primaires
Rapport final
ANS, mai 2020 | |
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| Document en français |
| Amendement - Contribution “Le Numérique au service de l’exercice pharmaceutique” Télésanté
l’Association nationale des étudiants en pharmacie de France, septembre 2020 | |
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| Document en français |
| Recherche d’information et indexation automatique des médicaments à l’aide de plusieurs terminologies de santé
Thèse présentée et soutenue publiquement le 23 Novembre 2010 par Saoussen Sakji
Université de Rouen | |
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| Document en anglais |
| Electronic Health Record (EHR) standards for India
30/12/2016 | |
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| Document en anglais |
| Real-World Data: Assessing Electronic Health Records and Medical Claims Data To Support Regulatory Decision- Making for Drug and Biological Products
Guidance for Industry
This guidance document is being distributed for comment purposes only
FDA September 2021
Real World Data/Real World Evidence (RWD/RWE) | |
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| Document en anglais |
| Working paper: an analysis of the IDMP medicinal product identification data provided by NCAs (and SPOR) compared to that needed in MPD for clinical care and for secondary uses
2019-2023. The participants of the UNICOM project | |
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| Document en français |
| Les statistiques provisoires sur les causes de décès en 2018 et 2019
Une nouvelle méthode de codage faisant appel à l’intelligence artificielle
DREES Méthodes, n° 8, le 8/3/2023 | |
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| Document en français |
| Guide de codification et valorisation des activités de pharmacie clinique dans les établissements de santé
Omédit PACA-Corse et Société Française de Pharmacie Clinique (SFPC), mars 2023 | |
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| Document en français |
| Présentation de l’Entrepôt de Données de Santé Normand (EDSaN) du CHU de Rouen (CISMeF), 6/11/2023 | |
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| Document en français |
| Notice technique, l’Agence technique de l’information sur l’hospitalisation (ATIH) détaille les nouveautés 2024, pour le champ d’activité des soins médicaux et de réadaptation (SMR, ex-SSR)soins médicaux et de réadaptation
ATIH, le 17/10/2023 | |
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| Document en français |
| Doctrine du Numérique en Santé 2023 | |
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| Document en français |
| Codes LOINC en fonction des différents types de documents du DMP (ANS) | |
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| Document en français |
| Ateliers de concertation de l’étude SNOMED CT
Atelier 2 – Cas d’usage des ressources sémantiques
ANS, 4 décembre 2020
Anatomie, médicament, oncologie, microbiologie | |
| ATC
La classification ATC (Anatomical Therapeutic Chemical classification system) s’applique à une spécialité pharmaceutique (Lien non faisable !). Elle comporte 5 niveaux de hiérarchie.
- 1er niveau : classe anatomique principale
- 2ème niveau : sous-classe thérapeutique
- 3ème niveau : sous-classe pharmacologique
- 4ème niveau : sous-classe chimique
- 5ème niveau : substance active
Exemple :
- classe anatomique : J Anti-infectieux généraux à usage systémique
- sous-classe thérapeutique : J01 Antibactériens à usage systémique
- sous-classe pharmacologique : J01F Macrolides, lincosamides et streptogramines
- sous-classe chimique : J01FF Lincosamides
- principe actif : J01FF01 Clindamycine
Un principe actif (Lien non faisable !) peut avoir plusieurs codes ATC si ceux-ci correspondent à des indications franches et reconnues. Comme l’indication principale peut varier d’un pays à l’autre, l’ATC peut varier d’un pays à l’autre pour un même principe actif. | Un code ATC est attribué pour une présentation lors de son AMM (Lien non faisable !) mais l’OMS administre une classification ATC qui peut comporter des différences
En HL7 la classification ATC a pour OID (codeSystem=’2.16.840.1.113883.6.73’) et pour libellé (codeSystemName=’code ATC’) | |
| Code Identifiant de Présentation (CIP)
Code identifiant à 13 chiffres correspondant à l’Autorisation de Mise sur le Marché (AMM (Lien non faisable !)) d’une présentation (Lien non faisable !) d’un médicament (Lien non faisable !). Ce code est administré par l’ANSM (Lien non faisable !).
Voir aussi Code Identifiant de Spécialité (CIS (Lien non faisable !)) et Unité Commune de Dispensation (UCD (Lien non faisable !)). | | |
| Code Identifiant de Spécialité (CIS)
Code numérique de 8 chiffres identifiant une spécialité pharmaceutique (Lien non faisable !). Il est administré par l’ANSM (Lien non faisable !).
Voir aussi Code Identifiant de Spécialité (CIP (Lien non faisable !)) et Unité Commune de Dispensation (UCD (Lien non faisable !)). | | |
| Répertoire Partagé des Professionnels de Santé (RPPS)
Répertoire assignant à chaque professionnel de santé (chirurgiens-dentistes, médecins, pharmaciens, sages-femmes) exerçant en France un identifiant à 11 chiffres, unique, pérenne et « non significatif » (ne comportant aucune information d’âge ou de localisation). Cet identifiant est utilisé dans le référentiel d’interopérabilité de l’ASIP. | | |
| Unité Commune de Dispensation (UCD)
Code identifiant à 13 chiffres correspondant au plus petit élément commun à plusieurs présentations d’une même spécialité pharmaceutique (Lien non faisable !).
Il est utilisé par les établissements de soins pour identifier les spécialités dispensés. Il est utilisé pour la facturation des médicaments hors GHS.
Le code UCD et le nombre d’UCD par présentation sont administrés par le Club Inter Pharmaceutique.
Voir aussi Code Identifiant de Preésentation (CIP (Lien non faisable !)) et Code Identifiant de Spécialité (CIS (Lien non faisable !)). | Situations où l’UCD diffère de la spécialité (Lien non faisable !) = médicaments de même teneur mais de volume différent.
Exemple : 1 spécialité albumine humaine XX 200g/l mais 2 UCD car flacons de 50 et 100ml | |
| Dématérialisation de la vignette des boîtes de médicaments (1 juillet 2014)
Dans le Datamatrix on trouve :
- CIP (Lien non faisable !) 13 chiffres
- numéro de lot
- date d’expiration
Sur la vignette papier on trouvait :
- CIP 7 ou 13 chiffres
- Prix Public Toutes Taxes Comprises (PPTTC et pas le Prix Fabricant Hors Taxe)
- taux de remboursement. | | |
| RIM HL7
CDA release 2, version 2.07 du RIM
Un document est un acte au sens du RIM
Entity : entité physique ou organisation capable de participer à une action
Activité : une classe acte est l’enregistrement de cette activité
Rôle : spécialisation d’une entité, peut être défini sans tenir compte de l’action. Le rôle est attribué par une Entity
Participation : fonction assumée dans le contexte de l’acte (c’est en fait aussi une classe associative)
+ classe d’association
- Act relationship relie 2 actes
- Role link relie 2 rôles
Attribut structurel du RIM codés avec des valeurs fixées du RIM
Entity class code : LIV (living subject), PRS (person), ORG (organisazation)
Entity determiner code : Kind (groupe de personne), Instance (une personne)
mood code : est-ce que l’acte est prévu, planifié, demandé, validé,...
NullFlavor : signifie que la valeur ne peut pas être transmise, est accompagnée de la raison de non-transmission (inconnu, non demandé,...) | | |
| « On ne sort de l’ambiguïté qu’à ses dépens. »
Cardinal de Retz | | |
| Le codage interne et les formats d’export de WikiPE sont conformes aux standards d’interopérabilité, notamment :
- les codes de langue ISO 639-1
- les extensions de fichier Windows | | |
| Anotateurs :
- Brat
- Prodigy
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